臺大團隊解碼臺灣帝雉基因 研究成果登國際期刊
臺大跨領域研究團隊執行「臺灣帝雉全基因體解碼計劃」,成功組裝出第一個帝雉的基因體序列圖譜,不僅首次達成國內特有種鳥類的全基因體解碼,更是全球第一種完成全基因體解碼的長尾雉屬鳥類,研究成果已刊登於國際知名期刊《GigaScience》。
臺灣帝雉又稱帝雉或黑長尾雉,不僅是國際自然保護聯盟紅皮書列爲近危物種之一的鳥類,也是我國政府的保育類野生動物,因具有稀有性,長期成爲社會各界關注焦點,更是我我國千元大鈔背後的主角動物。
在科技部、臺北市立動物園資助下,臺大電機資訊學院生醫電子與資訊所所長莊曜宇所領導的團隊,由約160倍的基因體片段序列之巨量資料中組裝出超過10億個鹼基對的帝雉基因體序列圖譜,再借由生物資訊的分析方法,對大約1萬6000個基因進行註解及功能性分析。
莊曜宇的團隊分析發現,帝雉可以生活在1600公尺到3000公尺的中高海拔環境,與負責能量代謝、氧氣運輸、血紅蛋白結合、輻射反應和DNA修復等功能基因受到演化適應上的正向選擇和基因數量擴張有關。
莊曜宇說,藉由首度完成的組裝帝雉的完整粒腺體DNA序列,並與其他親緣關係接近之長尾稚進行演化分歧時間分析後,推測帝雉可能出現在距今約347萬年前的臺灣,從古地理學中臺灣島形成的時間也支持的這個假設。
研究也發現,帝雉擁有與原雞相類似的基因組成結構,此結果未來將有助於本土鳥類的禽流感預防與治療等研究,提供重要的線索及資源。
莊曜宇指出,透過帝雉基因圖譜的解讀,除了提供鳥類生物資源的永久保存外,更能獲得在保育和覆育工作上所需的物種特性資訊,解答帝雉在演化上、環境適應力等各種性狀跟基因間關連性的相關問題。