新教育部長支持太陽花學運 吳思瑤：吳茂昆有四大特點
行政院16日晚公佈新任教育部長人選，由前東華大學校長吳茂昆出任，但此時卻被爆出其赴中開講座、溢領獎助金等爭議問題等，引發各界聲浪不斷傳出負評；臺大校長遴選案，由吳茂昆接掌教育部後，依權責將決定是否聘任管中閔，仍在審查中。
教育部長潘文忠因爲卡管事件14日請辭，16日行政院就召開記者會宣佈由中硏院院士、東華大學前校長吳茂昆接任，但吳茂昆卻頻頻被爆料；國民黨立委許淑華17日指出，吳茂昆擔任東華大學校長期間，每年違法加領講座教授獎助金、學術獎勵金並享有一切福利。
而吳思瑤站出來表示，新任教長吳茂昆有四大特點，一是嫺熟高教事務，曾經是東華大學校長；二是有諾貝爾獎被提名人的學術成就；三是擔任過行政院國家科學會主委，有行政經驗；四是作風大膽，擔任東華校長的時期，率先公開支持太陽花學運。
針對新教長案，吳思瑤說東華大學溢領案過去吳茂昆已經澄清，此事就不予評論，至於赴陸講座以及中科院的事情也有第一時間表示清楚，以「中研院物理所與中國科學院籤屬合作協議的短期交流」，申請符合規定，因此沒有違反任何法規問題。
對於近期管中閔案鬧得雞飛狗跳，吳思瑤表示不認爲新部長就要有新做法，應照既定程序走，期盼吳茂昆要有果斷的處事能力，若適法性釐清都妥善，「該怎麼辦就麼辦，採取適當作爲」。