昔講木馬屠城今爭直航？ 賴清德反批馬英九：不厚道
賴清德9日舉行上海行的返國記者會，針對總統馬英九7日所批評的「以前講兩岸直航是『木馬屠城』現在卻在積極爭取」，他迴應，總統應該有總統的高度，不能爲了選舉，就趁人不在家來誤導視聽，實在不厚道。賴清德還說，他談到木馬屠城的平媒專訪現在都還在網路上，大家去查就知道馬英九的說法是過度簡略。
馬英九日前在賴清德訪陸期間，以國民黨主席身分到臺南出席「固本會報」。他在席間批評，賴清德以前擔任立委時期，宣稱兩岸直航根本是木馬屠城，但現在成爲市長後，又在積極爭取臺南機場升格國際機場、與大陸城市直航，前後「判若兩人」，說出這麼扭曲言論的人，真的適任臺南市長嗎？他呼籲臺南鄉親支持國民黨的黃秀霜。
臺南市政府8日晚間發表迴應表示，馬總統於賴市長出訪上海之際，前來臺南批評市政，所陳內容不但沒有根據也有失厚道，臺南市政府表達最深的遺憾。
迴應還說，兩岸直航在民進黨執政時即開始規劃，賴市長時爲黨團幹事長，對於政策十分熟稔，不但支持更協助推動，民進黨一向主張兩岸應進行溝通與交流，如果沒有民進黨的規劃與先期準備作業，2008年馬總統就任後，怎可能在短短几個月內就可以啓動兩岸直航，馬總統所稱「賴市長在擔任立委任內，宣稱兩岸若開放直航，根本是木馬屠城記」其根據何在？請總統說明白。
迴應更指出，賴市長與市府團隊在合併升格後近三年半來兢兢業業推動市政，不但獲得市民支持，也獲得中央機關超過700項評比獎項，總統爲了拉擡黨提名候選人的選舉操作，對市府團隊做出沒有根據的批評，不但有失公允且有失總統應有的高度，非臺南市民所樂見。臺南市政府期待中央與地方應共同攜手合作，爲全體市民及我們生活的這塊土地努力，纔是臺灣之福，這都不應隨着選舉而改變。
而賴清德9日上午舉行上海行返國記者會，也再度提到上述事件，他指出，如果是針對《自由時報》的專訪內容，建議要仔細看清楚，馬總統做這樣的指控，過於簡略，「把它簡化爲我反對直航，或是(說我)認定直航是木馬屠城，這個是太嚴重了、太嚴重了。」
除了就「木馬屠城」的爭議與馬總統隔空對槓，賴清德還澄清了關於是否選2016的問題。他表示，早已決定競選臺南市長連任，既然要選，自然就是打算把任期做好、做滿。